Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna4O35343 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna4O35343 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kpna4O35343 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna4O35343 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna4O35343 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna4O35343 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna4O35343 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna4O35343 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna4O35343 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna4O35343 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna4O35343 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms