Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3aO08665 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3aO08665 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema3aO08665 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3aO08665 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema3aO08665 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema3aO08665 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3aO08665 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3aO08665 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3aO08665 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema3aO08665 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema3aO08665 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema3aO08665 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3aO08665 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sema3aO08665 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms