Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm2035J3QP87 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2035J3QP87 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2035J3QP87 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2035J3QP87 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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