Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4933406M09RikG3XA12 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
4933406M09RikG3XA12 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
4933406M09RikG3XA12 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4933406M09RikG3XA12 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4933406M09RikG3XA12 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4933406M09RikG3XA12 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4933406M09RikG3XA12 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
4933406M09RikG3XA12 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4933406M09RikG3XA12 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4933406M09RikG3XA12 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
4933406M09RikG3XA12 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4933406M09RikG3XA12 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4933406M09RikG3XA12 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
4933406M09RikG3XA12 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
4933406M09RikG3XA12 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
4933406M09RikG3XA12 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms