Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6H8

Amd2, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 2, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd2D3Z6H8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Amd2D3Z6H8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Amd2D3Z6H8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Amd2D3Z6H8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Amd2D3Z6H8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Amd2D3Z6H8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Amd2D3Z6H8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Amd2D3Z6H8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Amd2D3Z6H8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amd2D3Z6H8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amd2D3Z6H8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amd2D3Z6H8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amd2D3Z6H8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amd2D3Z6H8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amd2D3Z6H8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms