Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AU015836B2RUM3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AU015836B2RUM3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AU015836B2RUM3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AU015836B2RUM3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
AU015836B2RUM3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms