Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930435E12RikA6X8Z9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4930435E12RikA6X8Z9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930435E12RikA6X8Z9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930435E12RikA6X8Z9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930435E12RikA6X8Z9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930435E12RikA6X8Z9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930435E12RikA6X8Z9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930435E12RikA6X8Z9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930435E12RikA6X8Z9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms