Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561d1A2AE42 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyb561d1A2AE42 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyb561d1A2AE42 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyb561d1A2AE42 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms