Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CC2D2A-207ENST00000507954 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CRYAB-203ENST00000525823 915 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC133565.1-201ENST00000569218 488 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC018521.6-201ENST00000584276 335 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RPL35AP25-201ENST00000584631 330 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC074135.1-201ENST00000594318 581 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC01515-209ENST00000599409 755 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC010719.1-201ENST00000602992 747 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL157392.3-206ENST00000614899 822 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NUDT13-208ENST00000617744 928 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC010320.5-201ENST00000619124 676 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 STK32A-209ENST00000626951 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AP000851.2-201ENST00000629499 721 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC130464.1-201ENST00000416201 1500 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SLC16A1P1-201ENST00000486743 1510 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 BSPH1-201ENST00000344839 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL590730.1-202ENST00000418875 321 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC016877.1-201ENST00000420417 464 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CELF2-AS2-202ENST00000432370 1227 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MED28P8-201ENST00000454831 521 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC02010-201ENST00000470860 516 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PIGA-205ENST00000482148 1092 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC01184-206ENST00000508878 968 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC090568.2-203ENST00000521433 579 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC126755.2-209ENST00000531453 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AP000757.2-201ENST00000531850 557 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC138969.1-212ENST00000541593 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NPIPP1-203ENST00000547107 1071 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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