Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL77P-201ENST00000473332 294 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RPS14P7-201ENST00000473701 448 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC114812.3-201ENST00000509542 730 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC107220.1-201ENST00000514347 1037 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 IGHVII-30-1-201ENST00000522218 301 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AP000757.1-202ENST00000525260 891 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC004224.2-201ENST00000574423 529 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL157931.1-201ENST00000575845 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC026150.3-201ENST00000602595 499 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL021878.2-201ENST00000602718 399 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC00837-203ENST00000608061 555 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC02018-202ENST00000608707 445 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC090099.1-204ENST00000623626 849 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC02086-204ENST00000628006 786 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LRRC31-204ENST00000523069 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC016582.1-201ENST00000592640 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 ZNF85-202ENST00000328178 2296 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL031676.1-201ENST00000412519 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 MIPOL1-211ENST00000556451 2282 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 CLEC1A-203ENST00000420265 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL121885.2-201ENST00000440255 819 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RDH10-203ENST00000519380 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AP000820.1-201ENST00000545912 506 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC117498.2-202ENST00000549864 473 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC125421.2-202ENST00000580776 477 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC005722.3-201ENST00000580884 446 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC004477.2-201ENST00000583349 192 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 MIR5008-201ENST00000584300 94 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC243960.5-201ENST00000597858 255 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC009053.4-201ENST00000614366 108 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL031772.1-216ENST00000619494 697 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC127070.5-201ENST00000623177 2104 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 OR7A2P-202ENST00000641312 1219 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RNF214-204ENST00000530849 2846 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms