Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 INTS6-AS1-218ENST00000598905 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AL583859.2-202ENST00000602311 505 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AL136141.1-201ENST00000605780 369 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 C2orf83-204ENST00000641422 291 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 CPB1-201ENST00000282957 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 GNRH1-201ENST00000276414 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC079584.1-201ENST00000426716 464 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AL606804.1-202ENST00000446347 481 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC114786.3-201ENST00000509304 705 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AF186996.3-201ENST00000509527 964 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 OR7E2P-201ENST00000533071 889 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RAP1B-230ENST00000543697 734 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BEST4Q8NFU0 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms