Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 BMP2KL-201ENST00000414251 1225 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01424-201ENST00000417820 1031 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC00869-202ENST00000430442 1065 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AP001595.1-201ENST00000435878 516 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC087241.3-201ENST00000542076 862 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC074051.4-201ENST00000564888 892 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ZNF559-205ENST00000586255 1016 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ZNF528-AS1-204ENST00000601562 1069 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SLC25A51-201ENST00000242275 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 NPM1P30-201ENST00000425092 828 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RN7SL587P-201ENST00000459853 281 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 HOXB-AS1-203ENST00000504972 680 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC064807.3-201ENST00000523810 470 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC012574.1-201ENST00000523874 252 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC011840.3-201ENST00000579378 280 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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