Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC103409.1-201ENST00000521199 564 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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