Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCF23Q7RTU1 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC111000.1-201ENST00000514545 713 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC009119.1-202ENST00000567342 543 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms