Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 U3.48-201ENST00000363172 216 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms