Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 RPS14P7-201ENST00000473701 448 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC009119.1-202ENST00000567342 543 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL078621.1-201ENST00000272567 768 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RPL24P8-201ENST00000446071 474 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RASGRF2-AS1-201ENST00000505107 665 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms