Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SLC16A4-206ENST00000472422 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
SPTBN1Q01082 ACVR1-201ENST00000263640 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
SPTBN1Q01082 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 CLDN16-201ENST00000264734 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AL360295.1-201ENST00000425435 1824 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 MGC15885-201ENST00000558940 2425 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 USP32P1-202ENST00000393005 3846 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 MAP3K7CL-201ENST00000286791 1725 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 RCAN3-203ENST00000412742 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 PARP9-201ENST00000360356 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AL359076.1-201ENST00000426860 420 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC104389.2-201ENST00000450768 887 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 MSANTD3-206ENST00000613183 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 ZNF610-207ENST00000601151 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SPTBN1Q01082 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms