Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ALKBH8-202ENST00000389568 2491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 EIF4A1P13-201ENST00000415667 230 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OR5M13P-201ENST00000433944 937 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC114928.1-201ENST00000446516 415 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms