Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 ATP9B-208ENST00000586722 1650 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 LINC01424-201ENST00000417820 1031 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 GAPDHP46-201ENST00000424043 994 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 DBIL5P-202ENST00000453414 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 NMNAT1P4-201ENST00000505598 840 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 PTPN20-228ENST00000513266 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC008677.3-201ENST00000519146 666 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 LINC01591-202ENST00000522279 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 DCN-207ENST00000546370 586 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC034102.7-201ENST00000550840 470 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AL583859.2-202ENST00000602311 505 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 STSP1-201ENST00000412493 1151 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 LINC01392-201ENST00000419883 565 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC71LQ8N9Z2 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms