Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 CH17-340M24.3-201ENST00000360656 598 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC009967.1-201ENST00000379462 793 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC092580.2-201ENST00000414654 469 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 TRPC6P-201ENST00000421233 880 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC092100.1-203ENST00000421513 653 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 FAM136BP-201ENST00000428729 417 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 LINC00475-206ENST00000434944 796 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AL512353.1-203ENST00000444563 610 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 MARK2P14-201ENST00000449657 628 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 PRMT8-203ENST00000452611 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 PGAM4-201ENST00000458128 765 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 RAB5CP2-201ENST00000505368 637 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC005841.1-201ENST00000547042 287 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 OR4C45-201ENST00000568934 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC010332.1-201ENST00000620439 97 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 FAM122B-206ENST00000486347 1381 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 VNN3-212ENST00000519686 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 MOSPD1-203ENST00000370783 2364 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 EFTUD2-223ENST00000592576 3364 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 HSD17B2-201ENST00000199936 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 OR3A4P-202ENST00000624752 1461 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC073525.1-203ENST00000547040 2631 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 PACRG-201ENST00000337019 1619 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 PPM1A-201ENST00000325642 1713 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC091885.2-201ENST00000510391 1791 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 NOS2P3-202ENST00000458685 3328 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 SYNE1-211ENST00000413186 4860 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 OR5M9-201ENST00000279791 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 RN7SKP294-201ENST00000362770 338 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 MIR503-201ENST00000385270 71 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 ERICH2-201ENST00000409885 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 MED15P4-201ENST00000417579 393 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AL353779.2-201ENST00000424917 308 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 RPL12P29-201ENST00000425565 457 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AC092162.2-203ENST00000430460 579 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 GAPDHP68-201ENST00000434621 1008 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AL591806.1-201ENST00000447167 1109 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NBR1Q14596 HS6ST2-AS1-201ENST00000455269 550 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms