Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 FOXG1-AS1-203ENST00000551395 602 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC016542.3-201ENST00000623520 619 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms