Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 NEDD1-203ENST00000429527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC068547.1-203ENST00000637559 1373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 GDNF-AS1-204ENST00000637595 1886 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 CDH23-213ENST00000619887 4224 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 NDE1-201ENST00000396354 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 FPR3-202ENST00000595991 2222 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 SORD-201ENST00000267814 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 MAPK10-386ENST00000642038 2354 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 MEIS2-203ENST00000340545 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 HCAR3-201ENST00000528880 2137 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 PPIP5K1-202ENST00000348806 5433 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ZNF30-206ENST00000601957 2583 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PSEN1P49768 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 SIRPG-201ENST00000216927 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 OR52K1-201ENST00000307632 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 SCIMP-201ENST00000399600 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL583835.2-203ENST00000407271 440 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RNA5SP304-201ENST00000411199 104 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 SLC25A5P4-201ENST00000418448 869 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC145543.1-201ENST00000424770 586 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PSEN1P49768 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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PSEN1P49768 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 CDH7-202ENST00000397968 12231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 RMND1-201ENST00000336451 1413 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 ZBTB10-201ENST00000379091 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 AC006213.2-201ENST00000587128 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 TRIM52-205ENST00000611618 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 MPI-201ENST00000323744 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 MEF2C-203ENST00000437473 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 ZNF780A-202ENST00000414720 2396 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PSEN1P49768 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 NSUN7-201ENST00000316607 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PSEN1P49768 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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