Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AL109918.1-201ENST00000602367 3039 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 CDK15-202ENST00000410091 1780 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 USP40-203ENST00000427112 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC245014.1-201ENST00000427732 381 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms