Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC244021.2-201ENST00000445260 529 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 RPL34-204ENST00000502534 560 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC013643.2-201ENST00000521510 584 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AL133304.1-201ENST00000548199 549 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC011509.2-201ENST00000592263 627 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LINC02532-210ENST00000606430 584 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AL021807.1-201ENST00000607175 565 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 RNA5SP483-201ENST00000363431 118 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LINC00460-201ENST00000435024 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LYPD6B-207ENST00000450639 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 ASPA-202ENST00000456349 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 C1orf112-208ENST00000496973 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AP003385.2-201ENST00000524910 973 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 PDCD6IPP2-205ENST00000565892 498 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC090415.1-201ENST00000581877 847 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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