Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC009716.1-201ENST00000583287 398 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 CFAP61-203ENST00000377293 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms