Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 IYD-207ENST00000425615 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AP000757.2-201ENST00000531850 557 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC005154.1-216ENST00000582145 1101 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC006547.1-211ENST00000609191 828 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MFSD8-234ENST00000641503 1082 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC092979.1-201ENST00000488190 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC01392-201ENST00000419883 565 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 G6PC2-204ENST00000429379 645 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF195-208ENST00000438262 1018 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC084809.2-201ENST00000444464 512 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RN7SL798P-201ENST00000468562 301 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC112219.1-201ENST00000491567 947 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP82-208ENST00000496652 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC009090.1-201ENST00000562409 358 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC010530.1-201ENST00000602844 569 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL391807.1-201ENST00000603261 712 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC211469.1-201ENST00000604263 394 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC019322.2-201ENST00000605634 147 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.30-201ENST00000621054 280 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC105383.1-202ENST00000505289 2820 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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