Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 ETFBKMT-203ENST00000412352 1083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC005840.3-201ENST00000541888 1803 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC078955.1-201ENST00000547123 882 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms