Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RECQLP46063 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RECQLP46063 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RECQLP46063 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RECQLP46063 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RECQLP46063 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RECQLP46063 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RECQLP46063 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 OR52A1-201ENST00000328942 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC007365.1-201ENST00000439964 627 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL353898.3-201ENST00000624679 1755 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RECQLP46063 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 RPL5P27-201ENST00000437011 881 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RECQLP46063 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms