Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 FBP2P1-202ENST00000424473 530 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC080112.3-201ENST00000612552 880 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ZFP2-205ENST00000523286 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL078621.1-201ENST00000272567 768 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms