Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC018892.2-201ENST00000457656 693 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RPL34-204ENST00000502534 560 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 OR4N3P-201ENST00000559395 818 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC010530.1-201ENST00000602844 569 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC135068.4-201ENST00000622949 925 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC002094.5-201ENST00000623773 629 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CASP4-201ENST00000393150 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ULK4P3-201ENST00000563895 440 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ZNF559-205ENST00000586255 1016 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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