Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TRBV7-4-201ENST00000390369 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 Z93930.2-202ENST00000418292 208 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC00578-201ENST00000439009 542 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC074121.1-201ENST00000441836 348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RPL10P19-203ENST00000522289 663 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LRTOMT-212ENST00000536917 579 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC063923.2-201ENST00000562158 928 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ZNF611-214ENST00000600943 560 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ZNF98-205ENST00000601553 566 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC239803.3-201ENST00000614663 494 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC093495.1-212ENST00000630173 1162 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 OGFOD1P1-201ENST00000447552 1592 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ZFAND1-214ENST00000521287 772 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC091820.2-201ENST00000521697 523 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 STARD13-AS-247ENST00000610879 779 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2BM-201ENST00000621112 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CU638689.2-201ENST00000623809 818 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC074198.1-201ENST00000506546 1397 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RNU1-47P-201ENST00000362966 163 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SMIM30-201ENST00000397764 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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