Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LINC01132-201ENST00000437601 3793 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ANKRD20A11P-206ENST00000451663 3717 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 HLTF-208ENST00000494055 3633 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CCDC162P-214ENST00000640755 1958 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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PTPRMP28827 SIDT2-219ENST00000620360 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LINC01877-203ENST00000439734 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SCRN1-206ENST00000426154 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SLC8A1-206ENST00000406391 2814 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CFAP57-201ENST00000372492 4244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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PTPRMP28827 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PTPRMP28827 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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