Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms