Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCOA3Q9Y6Q9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms