Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms