Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG4BQ9Y4P1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms