Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms