Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF5Q9Y2D1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.7 ms