Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1024Q9UPX6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms