Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms