Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP2BPQ9P2M1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms