Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms