Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms