Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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GDAP2Q9NXN4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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GDAP2Q9NXN4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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GDAP2Q9NXN4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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GDAP2Q9NXN4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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GDAP2Q9NXN4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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