Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms