Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms