Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3FQ9H1D9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3FQ9H1D9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms