Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms