Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms