Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms